A sengoku korban élő Kagemitsu Daigo 48 démonnak ajánlja fel születendő gyermeke testrészeit, ha cserébe azok az ország uralkodójává teszik őt. Ezt követően a megcsonkított fabábúra hasonlító csecsemőt a folyóba dobja, azonban egy sámán megmenti a fulladástól, művégtagokat készít neki és felneveli a Hyakkimaru névre keresztelt fiút. Felnővén, Hyakkimaru elindul levadászni azokat a démonokat, akiktől visszaszerezheti testrészeit, és társat is kap az útra a Dororo nevű tolvajfiú személyében.