A Guilty-ben folytatódnak az érzelmi hullámok, rejtélyek, izgalmak. Kibontakoznak az első szériában elkezdődött események, a történet csak most kezdődik igazán... Történetünk Zero visszatérésével indít, aki az első széria utolsó epizódjában megízlelhette a Kuran Kaname-féle nemes vért. A Hiou Shizuka halála körüli felhajtásban sorra tornyosulnak a hazugságok: Zerot tekintik a tisztavérű vámpír gyilkosának, ezért kivégzéssel büntetnék. Yuuki szeretne minél többet megtudni elfeledett múltjáról, családjáról, de legfőképp eltűnt emlékeiről. Úgy érzi, Kaname valamit titkol előle, de lassanként mindenre fény derül. Ki is valójában Yuuki? És mi köze van annak a havas estének és Kaname-nek emlékei eltűnéséhez... A Kaname-Zero-Yuuki szerelmi háromszög szálai tovább bonyolódnak: Yuuki egy tiltott románc részese lesz. Nagyobb hangsúly helyeződik a többi szereplőre, Shiki és Aido karakterének jelentős szerepe lesz a végkifejletek során. Az első epizódban elhangzik az alapkérdés: ki is a tisztavérűek igazi ellensége?